Our Software

We developed several software packages and pipelines for our work.

nucMACC

A comprehensive tool for analyzing nucleosome positions, accessibility, and stability. 

DOI: 10.1126/sciadv.adm9740

nucDetective

The nucDetective pipeline is an easy-to-use software for MNase-Seq data analysis. It provides high quality nucleosome profiles and allows the analysis of nucleosome features even in complex experimental designs.

RNASeq_NAC

An in-house standard pipeline for RNA-Seq data analysis following best practices.

Triplex Predictor

Prediction of RNA-DNA Triplexes

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